Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APH1BQ8WW43 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1BQ8WW43 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APH1BQ8WW43 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms