Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWIST2Q8WVJ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWIST2Q8WVJ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWIST2Q8WVJ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms