Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCOLN3Q8TDD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN3Q8TDD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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