Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA94

ZNF563, Zinc finger protein 563, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF563Q8TA94 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF563Q8TA94 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF563Q8TA94 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF563Q8TA94 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms