Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARRDC4Q8NCT1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARRDC4Q8NCT1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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