Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SPC24Q8NBT2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPC24Q8NBT2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPC24Q8NBT2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms