Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF38AQ8NAV1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38AQ8NAV1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF38AQ8NAV1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF38AQ8NAV1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF38AQ8NAV1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF38AQ8NAV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF38AQ8NAV1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms