Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAAF3Q8N9W5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF3Q8N9W5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms