Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR7Q8N806 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR7Q8N806 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR7Q8N806 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms