Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYX3

CCDC116, Coiled-coil domain-containing protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC116Q8IYX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC116Q8IYX3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC116Q8IYX3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC116Q8IYX3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC116Q8IYX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC116Q8IYX3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC116Q8IYX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC116Q8IYX3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC116Q8IYX3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC116Q8IYX3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC116Q8IYX3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms