Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PPARGC1BQ86YN6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PPARGC1BQ86YN6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PPARGC1BQ86YN6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PPARGC1BQ86YN6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PPARGC1BQ86YN6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PPARGC1BQ86YN6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
PPARGC1BQ86YN6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PPARGC1BQ86YN6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PPARGC1BQ86YN6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PPARGC1BQ86YN6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms