Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALB2Q86YC2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALB2Q86YC2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALB2Q86YC2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PALB2Q86YC2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALB2Q86YC2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms