Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7N9

TMEM179B, Transmembrane protein 179B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179BQ7Z7N9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179BQ7Z7N9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM179BQ7Z7N9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM179BQ7Z7N9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM179BQ7Z7N9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM179BQ7Z7N9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM179BQ7Z7N9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM179BQ7Z7N9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM179BQ7Z7N9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM179BQ7Z7N9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM179BQ7Z7N9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms