Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RBBP6Q7Z6E9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBBP6Q7Z6E9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBBP6Q7Z6E9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms