Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEGR1Q7Z3B1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEGR1Q7Z3B1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEGR1Q7Z3B1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms