Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX7Q7RTT5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX7Q7RTT5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SSX7Q7RTT5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX7Q7RTT5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX7Q7RTT5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms