Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARCQ7LC44 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARCQ7LC44 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARCQ7LC44 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms