Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00173Q6ZV60 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms