Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMD7Q6ZUT3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD7Q6ZUT3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD7Q6ZUT3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMD7Q6ZUT3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD7Q6ZUT3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD7Q6ZUT3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD7Q6ZUT3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD7Q6ZUT3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD7Q6ZUT3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms