Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC1Q6VVB1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NHLRC1Q6VVB1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms