Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD1Q6UWL2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUSD1Q6UWL2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms