Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNIH2Q6PI25 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNIH2Q6PI25 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH2Q6PI25 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH2Q6PI25 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms