Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K1

SLC48A1, Heme transporter HRG1, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC48A1Q6P1K1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC48A1Q6P1K1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC48A1Q6P1K1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC48A1Q6P1K1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms