Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRNP1Q6NT89 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRNP1Q6NT89 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRNP1Q6NT89 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms