Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPRIN2Q6IMN6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms