Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms