Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCNX4Q63HM2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCNX4Q63HM2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCNX4Q63HM2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
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