Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT79Q5XKE5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT79Q5XKE5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT79Q5XKE5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT79Q5XKE5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT79Q5XKE5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT79Q5XKE5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT79Q5XKE5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT79Q5XKE5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT79Q5XKE5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT79Q5XKE5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms