Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01545Q5VT33 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01545Q5VT33 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms