Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRIF1Q5T3J3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIF1Q5T3J3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms