Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSL3PQ5NE16 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSL3PQ5NE16 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSL3PQ5NE16 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSL3PQ5NE16 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSL3PQ5NE16 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTSL3PQ5NE16 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSL3PQ5NE16 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSL3PQ5NE16 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSL3PQ5NE16 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms