Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NHLRC3Q5JS37 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
NHLRC3Q5JS37 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.2 ms