Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COBLL1Q53SF7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COBLL1Q53SF7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COBLL1Q53SF7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms