Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf17Q53FE4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf17Q53FE4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms