Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM259Q4ZIN3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms