Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIK1Q3SY52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIK1Q3SY52 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIK1Q3SY52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIK1Q3SY52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms