Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SWI5Q1ZZU3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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