Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF239Q16600 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF239Q16600 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms