Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY1Q16526 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY1Q16526 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY1Q16526 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms