Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXT1Q16394 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXT1Q16394 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT1Q16394 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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