Protein–RNA interactions for Protein: Q15542

TAF5, Transcription initiation factor TFIID subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF5Q15542 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF5Q15542 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF5Q15542 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TAF5Q15542 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF5Q15542 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF5Q15542 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms