Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2BQ14CS0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2BQ14CS0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2BQ14CS0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2BQ14CS0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms