Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD4Q14CM0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD4Q14CM0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRMPD4Q14CM0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD4Q14CM0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD4Q14CM0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD4Q14CM0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
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