Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SHPRHQ149N8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHPRHQ149N8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SHPRHQ149N8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
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