Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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