Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIGQ13278 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIGQ13278 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIGQ13278 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIGQ13278 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIGQ13278 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIGQ13278 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIGQ13278 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIGQ13278 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIGQ13278 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIGQ13278 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIGQ13278 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIGQ13278 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIGQ13278 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIGQ13278 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIGQ13278 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIGQ13278 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIGQ13278 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIGQ13278 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIGQ13278 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIGQ13278 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIGQ13278 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIGQ13278 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIGQ13278 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIGQ13278 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIGQ13278 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIGQ13278 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIGQ13278 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIGQ13278 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIGQ13278 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIGQ13278 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIGQ13278 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIGQ13278 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIGQ13278 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIGQ13278 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIGQ13278 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIGQ13278 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIGQ13278 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIGQ13278 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIGQ13278 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIGQ13278 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIGQ13278 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIGQ13278 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIGQ13278 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIGQ13278 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIGQ13278 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIGQ13278 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIGQ13278 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIGQ13278 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIGQ13278 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIGQ13278 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIGQ13278 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIGQ13278 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIGQ13278 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIGQ13278 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIGQ13278 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIGQ13278 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIGQ13278 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIGQ13278 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIGQ13278 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIGQ13278 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIGQ13278 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIGQ13278 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIGQ13278 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIGQ13278 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIGQ13278 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIGQ13278 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIGQ13278 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIGQ13278 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIGQ13278 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIGQ13278 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIGQ13278 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIGQ13278 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIGQ13278 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIGQ13278 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIGQ13278 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIGQ13278 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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