Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1B1Q10567 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1B1Q10567 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1B1Q10567 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms