Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSC1Q08554 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DSC1Q08554 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DSC1Q08554 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSC1Q08554 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms