Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN11Q06124 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN11Q06124 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN11Q06124 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms