Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2HP62256 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE2HP62256 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2HP62256 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms